Presidencia
La Presidencia pro témpore, es ejercida por un país miembro durante dos años, y tiene como principal atribución ser sede de las reuniones de la Comisión Mixta. Actualmente, la Presidencia pro témpore del Grupo EFSUR la ejerce la Contraloría General de la República del Paraguay representada por el Contralor General Dr. Camilo D. Benítez Aldana
Presidencias:
De 1997 a marzo de 1998: TCR Uruguay
Hasta abril 1999: CGE de Bolivia
Hasta mayo de 2000: CGR de Chile
Hasta abril de 2001: TCU de Brasil
Hasta septiembre de 2002: CGR de Paraguay
Hasta octubre de 2003: AGN de Argentina
Hasta diciembre de 2004: TCR de Uruguay
Hasta diciembre de 2005: TCU de Brasil
Hasta diciembre de 2006: CGE de Bolivia
Hasta noviembre de 2007: CGR de Chile
Hasta noviembre de 2008: CGR de Paraguay
Hasta septiembre de 2009: CGR de Venezuela
Hasta octubre de 2010: AGN de Argentina
Hasta noviembre de 2011: AGN de Argentina (reelección)
Hasta noviembre de 2013: CGR de Paraguay
Hasta octubre de 2014: CGR de Paraguay (reelección)
Hasta octubre de 2015: CGR de Venezuela
Hasta septiembre de 2016: CGE de Bolivia
Hasta setiembre de 2017: CGE de Ecuador
Hasta setiembre de 2018: CGE de Ecuador (reelección)
Hasta diciembre de 2019: CGE de Bolivia
Actualmente ejerce la Presidencia pro-témpore la CGR de Paraguay